DELPHI et SysMics - INFRASTRUCTURES NUMÉRIQUES POUR L’IMAGERIE ET L’IA POUR LA RECHERCHE EN SANTÉ-BIOLOGIE À NANTES

Data Images sur patient ou modèles animaux ou cellulaires (organoïdes)

Transfer learning, définition d'infrastructures et d'interopérabilité pour l'imagerie et l'intelligence artificielle

Organisé le 15 mars 2023 par Perrine PAUL-GILLOTEAUX, chargée de mission données SFR Bonamy, en collaboration avec les clusters DELPHI et SysMics de l'iSite NExT, Nantes Université, le CNRS, le CHU de Nantes et la Structure Fédérative de Recherche Bonamy, nous tenons à remercier la cinquantaine de personnes présentes qui ont bravé l’absence de transport en commun pour échanger avec les experts du CHU de Nantes et de Nantes Université pour partager une vision claire de la mise en place des infrastructures numériques et logicielles pour l'imagerie et l'intelligence artificielle IA côté clinique et côté recherche, pour les data images, sur patient ou modèles animaux ou cellulaires (organoïdes).

Nous remercions les intervenants et nous vous invitons à les contacter pour mettre possiblement en commun des efforts de développements, de partage de modèle pour le transfer learning, et de définition d'infrastructures et d'interopérabilité :

• Pierre-Antoine Gourraud et Geoffrey Desvaux - Projet GALAC HdS, clinique des données et proposition des DATA Day
• Audrey Bihouée - Orchestration des flux de données entre les plateformes productrices de données et les infrastructures de traitement : Projet national MUDIS4LS
• Alban Gaignard - FAIR-Checker, un outil "Sciences Ouvertes" proposé par l'infrastructure nationale de bioinformatique IFB
• Perrine Paul-Gilloteaux - La stratégie nationale de France Bioimaging concernant les données et le pôle d’histologie numérique pour la recherche en deep learning (Projet AAP 2021 Infrastructures ligériennes)
• Heidi Derrien - DaCas data centre régional
• Yann Capdeville - Glicid centre de calcul scientifique intensif
• Delphine Loussouarn - Déploiement de la pathologie numérique dans le service d'Anatomie Pathologique du CHU de Nantes
• Raphaël Bourgade - Développement de la recherche en pathologie computationnelle
• Charles Lepine - Mise en place de l'enseignement sur lame virtuelle au sein du pôle santé : un projet local à dimension nationale

Nous espérons que ces échanges auront contribués au fléchage des futurs projets accueillis sur ces infrastructures et aideront à mettre en place des initiatives communes.