François DELAVAT

J'enseigne principalement en microbiologie (de la L1 au Master)

Je travaille depuis de nombreuses années sur le comportement individuel, collectif et social de bactéries dans différents contextes environnementaux. Recruté en septembre 2019 à l'US2B (UMR CNRS/Nantes Université), mes recherches s'intéressent à l'écophysiologie de bactéries diazotrophes marines, dont l'activité est importnates pour le fonctionnement des écosystèmes marins

Les bactéries diazotrophes marines sont étudiées depuis plusieurs décennies et jusqu'à récemment, les cyanobactéries étaient considéres comme majoritaires et principales contributeurs de la fixation de N₂ dans les océans. Cependant, des analyses des données de Tara Oceans ont montré une grande diversité et abondance de bactéries diazotrophes marines n'appartenant pas au phylum des Cyanobactéries. Cependant, les conditions régulant la diazotrophie, la réponse génétique et physiologique de ces bactéries restent méconnues, et cette méconnaissance est due (i) au peu de bactéries diazotrophes non cyanobactériennes (DNC) cultivées en laboratoire et (ii) à l'absence d'outils génétiques pour ces souches.  et En utilisant Vibrio diazotrophicus comme modèle d'étude, nous nous intéressons à l'étude de l'écophysiologie de DNC marines, avec un focus sur leur comportement individuel.
 

Octobre 2021: Obtention de l'Habilitation à Diriger des Recherches (HDR)
Depuis septembre 2019: Maître de conférences à Nantes Université
2017-2019: Post-doc au LEMAR (Brest) sur l'étude des mécanismes moléculaires associés à la virulence d'organismes marins
2013-2017: Post-doc au DMF (Lausanne, Suisse) sur l'étude à l'échelle de la cellule unique du transfert de gènes entre bactéries du genre Pseudomonas
2009-2012: Doctorat en écologie microbienne (Strasbourg) sur les bactéries vivant dans un drainage minier acide
2007-2009: Master en Biologie des microorganismes (Université de Strasbourg)
2006-2007: Licence 3 en Biologie Moléculaire et Cellulaire (Université de Strasbourg)
2005-2006: année ERASMUS à Düsseldorf (Allemagne)
2003-2005: L1 et L2 à l'université de Bretagne Sud

Selected publications (>20 publications)

(underlined: supervised researchers)
E. Agranier, P. Crétin, A. Joublin-Delavat, L. Veillard, K. Touahri and F. Delavat. Development and utilization of new O2-independent bioreporters. Microbiology Spectrum 2024
D. Oyanedel, (…) F. Delavat, (…), and D. Destoumieux-Garzón. Cooperation and cheating orchestrate Vibrio assemblages and polymicrobial synergy in oysters infected with OsHV-1 virus. PNAS 2023, 120(40) e2305195120

A. Joublin-Delavat, (...), F. Delavat. Genetic and physiological insights into the diazotrophic activity of a non-cyanobacterial marine diazotroph. Environ Microbiol 2022, 24, 6510-6523
A. Morot, (...) F. Delavat. Virulence of Vibrio harveyi ORM4 toward the European abalone Haliotis tuberculata involves both quorum sensing and a type III secretion system. Environ Microbiol 2021, 23(9):5273-5288
F. Delavat, R. Moritz and J. R. van der Meer. Transient replication in specialized cells favors conjugative transfer of a selfish DNA element. mbio 2019 10 (3) e01133-19.
F. Delavat, (...), and J. R. van der Meer. The hidden life of integrative and conjugative elements. FEMS Microbiol Rev 2017 41: 512-537
F. Delavat, S. Mitri, S. Pelet and J. R. van der Meer. Highly variable individual donor cell fates characterize robust horizontal gene transfer of an integrative and conjugative element. PNAS 2016, 113: E3375-3383

Projets obtenus:

2024-2025: projet AGENCY (EC2CO-CNRS). PI, 50 k€, en collaboration avec S. Rodrigues (LBCM-UBS) et J-F Maguer (LEMAR, UBO)

2022-2025: “Contrat doctoral GdR OMER” (CNRS-MITI). PI, 125 k€

2022 : « Diversity of Biological Mechanisms » (CNRS-INSB). PI, 17 k€

2020-2024 : projet SMIDIDI (Etoiles Montantes de la région Pays de la Loire.) PI, 148 k€

2019-2020 : « EC2CO» du CNRS (Conception et co-rédaction. Porteur officiel : Pr. Vianney Pichereau, UBO). 36 k€

2019-2020 : « Programme de prématuration » du CNRS (Conception et co-rédaction. Porteur officiel : Pr. Vianney Pichereau, UBO). 120 k€

2019 : « Boost’ERC » de la région Bretagne. PI, 20 k€

2017-2019 : Bourse « Post-doctorat d’excellence » du LabexMER. PI, 110 k€ [Équipement, consommables, salaire post-doc personnel]

2013 : « Prix de thèse » de la Fondation Université de Strasbourg. 1,5 k€
 

Groupe de recherche

Pauline Crétin: Doctorante, 2022-2025
Louise Mahoudeau: M2 puis assistante-ingénieur, 2024
Plusieurs M1 et M2 chaque année